En 1930, por iniciativa de la Señora Hersilia Casares de Blaquier se crea el Patronato de Leprosos. Esta institución envía al Dr. José M. Fernández, destacado leprólogo rosarino, a estudiar la organización de las leproserías en el mundo para aplicarlo luego a nuestro país.

Es así que se proyecta la construcción de 7 sanatorios colonias de los cuales se concretarán sólo 5 en varias provincias, entre ellas la de Buenos Aires.

En ella se busca una zona alejada de las poblaciones y así se elige un campo situado en el cuartel cuarto del partido de Gral. Rodríguez. La iniciativa despierta una gran oposición de las autoridades municipales y de los vecinos de la zona. A pesar de ello se adquieren 7 lotes de campo que la familia Fonseca había comprado en 1928 al señor Martín de Alzaga y que posteriormente vende en subasta pública el Banco Hipotecario Nacional por cobro de una deuda el 14 de junio de 1933.

El gobierno de la Nación compra estos inmuebles por el precio de 138.400 pesos moneda nacional.

El presidente de la Nación, Agustín P. Justo, con el acuerdo de sus ministros emite un decreto aprobando la adquisición del predio con destino a instalar un asilo colonia de dermatosos, en cumplimiento de las leyes 11.359 y 11.410.

El 13 de marzo de 1934 se firma el acta de posesión. El 31 de diciembre de 1936 se protocoliza la escritura y en febrero de 1937 comienza la construcción de este hospital nacional.

Finalmente, el 22 de noviembre de 1941 se inaugura oficialmente con el nombre de Sanatorio Colonia Buenos Aires, con la presencia del vicepresidente de la Nación en ejercicio del poder ejecutivo Dr. Ramón S. Castillo.